Sobre el evento
Descripción general:
Les damos la bienvenida a las primeras Jornadas Andaluzas de BioInformática (JABI 2023), un foro de interacción desde el que se fomenta la sinergia dentro de la creciente comunidad de bioinformática en Andalucía.
Las JABI entienden la bioinformática en su sentido más amplio, como una disciplina que aglutina grupos que trabajan en ciencia de datos, biología computacional, genómica, biología de sistemas, evolución, estructura de biomoléculas, agricultura, informática médica, inteligencia artificial, etc., y desde un abanico de aproximaciones que va desde la investigación básica basada en datos a la orientación técnica del desarrollo de aplicaciones y software bioinformático.
Es un hecho que el abaratamiento de las tecnologías de producción de datos, como las distintas ómicas, imagen, datos clínicos, etc., está provocando un crecimiento en la comunidad bioinformática. En Andalucía existe un importante número de grupos con amplia experiencia en el manejo de datos ómicos y una clara orientación traslacional que conviven con otros grupos que provienen de la Ingeniería Informática con sólidos conocimiento en modernas técnicas de estadística e inteligencia artificial (IA) y vocación de aplicar estos conocimientos a problemas de biomedicina. También, numerosos grupos de investigación en biología molecular, clínicos, agricultura, etc. están dando el salto al análisis de datos incluyendo profesionales con perfil bioinformático en equipos teórico-experimentales.
Las JABI pretenden ser un foro de referencia en Andalucía para promover el intercambio de experiencias y conocimiento en la comunidad bioinformática de Andalucía y el establecimiento de relaciones entre grupos con intereses comunes o complementarios.
Comité de organización
Comité organizador:
- Joaquin Dopazo Blázquez, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
- Francisco Manuel Ortuño Guzmán, Plataforma de Medicina Computacional / Universidad de Granada
- Coral del Val, Universidad de Granada
- Antonio J. Pérez Pulido , Universidad Pablo de Olavide
- Manuel Gonzalo Claros, Universidad de Málaga
- Pedro Carmona, Universidad de Granada / GENyO
- Isabel Nepomuceno, Universidad de Sevilla
Comité local:
- Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
- Inmaculada Guillén, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
- Belén Vega Márquez, Universidad de Sevilla
Comité estudiantes:
- Kristina Lacasta López, Universidad de Sevilla
- Gema Misra Cabezas, Universidad de Sevilla
- Rocío Jiménez Arias, Universidad de Sevilla
- Noelia Collado Gisbert, Universidad de Sevilla
- María González Genil, Universidad de Sevilla
- Carmen Rodríguez Res, Universidad de Sevilla
Fechas
- Fecha del evento: del 3 al 5 de Julio de 2023
- Apertura de registro y envio de comunicaciones: 10 de Abril de 2023
- Fecha límite de envio de comunicaciones:
22 de Mayo2 de Junio de 2023 - Notificaciones de comunicaciones:
9 de Junio12 de Junio de 2023 - Fecha límite de registro: 15 de Junio de 2023
Dónde
ETS de Ingeniería Informática:
Universidad de Sevilla, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Salón de actos
Av. Reina Mercedes s/n, 41012 Sevilla
Programa
Inicio del evento
Registro
Confirmación de los datos de inscripción.
Inauguración de las JABI
D. Isaac Túnez Fiñana. Secretario General de Investigación, Desarrollo e Innovación
Consejería de Salud y Consumo, Junta de Andalucía
D. Gonzalo Balbontín Casillas. Director Gerente
Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud
Dña. Ana María Porcel Gálvez. Directora del Secretariado de Promoción de la Investigación
Universidad de Sevilla
Dña. Cristina Rubio Escudero. Subdirectora de Relaciones Internacionales, Comunicación y Divulgación, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla
D. Joaquín Dopazo Blázquez. Director de la Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
Sesión 1 - Agricultura y Bioinformática
Chairman: Antonio J.Pérez Pulido, Universidad Pablo de OlavideCod: s1_1
EasyGDB: una herramienta de libre acceso de fácil implementación y mantenimiento para el desarrollo de portales genómicos. El caso del atlas de olivo Amanda Bullones
Instituto Hortofruticula Subtropical y Mediterránea "La Mayora" (IHSM - CSIC - UMA), Málaga
Cod: s1_2
Combining Long-Read and Short-Read Sequencing Technologies in the Study of a Red Spider Mite-Resistant Mutant of S. lycopersicum: Technical Aspects and (Epi)-Transcriptomics. José María Medina Muñoz
Universidad de Granada
Cod: s1_3
Técnicas bioinformáticas para el estudio de modificaciones postraduccionales: el caso de la carbonilación en polen de olivo (Olea europaea L.) Salvador Priego Poyato
Estación Experimental del Zaidín (CSIC), Granada
Cod: s1_4
RSeqFlow, an R markdown workflow tailored for olive pollen tube growth profiling M.Gonzalo Claros
Instituto Hortofruticula Subtropical y Mediterránea "La Mayora" (IHSM - CSIC - UMA), Málaga
Descanso / Café
Charla plenaria: Base Poblacional de Salud. Un recurso para la generación de Conocimiento y Salud Dolores Muñoyerro
Subdirectora de Gestión de la Información en el Servicio Andaluz de Salud
Sesión 2 - IA, aprendizaje automático y profundo en Bioinformática I
Chairman: Isabel Nepomuceno, Universidad de SevillaCod: s2_1
Homological tools of boundary-scale models for analysis of Biological Graphs Alberto Monterroso Muñoz
Universidad de Sevilla
Plataforma de gestión y análisis de bioseñales cerebrales y modelo predictivo de detección de potenciales evocados auditivos basado en IA Sergio Blanco Trejo
Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla
Reducción del batch effect para métodos de Machine Learning en espectros de Mycobacterium generados con MALDI-TOF Erica Padial Fuillerat
Clover Bioanalytical Software,Granada
Mesa redonda: Inteligencia Artificial y Bioinformática
Moderador: D. Joaquín Dopazo Blázquez. Director de la Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
Codificación y explotación eficiente de datos clínicos mediante IA y NLP - Carlos Rodríguez Abellán. Lead NLP Engineering, Centro de Excelencia Global de Data Intelligence, Fujitsu
Herramientas computacionales para extracción de información de una historia clínica oncológica - Jose Manuel Jerez Aragonés. Catedrático de Universidad, Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación, Universidad de Málaga
Sebastian Ventura. Catedrático de Universidad, Departamento de Ciencias de la Computación y Análisis Numérico, Universidad de Córdoba
Descanso / Café
Charla plenaria: Nuevas estrategias en Bioinformática para el tratamiento contra el cáncer Fátima Al-Shahrour
Directora Unidad de Bioinformática en el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)
Sesión 3 - Microbiología y Bioinformática
Chairman: M.Gonzalo Claros Diaz, Universidad de MálagaVigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Andalucía: origen, hitos y estado actual Javier Pérez Florido
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Cod: s3_2
CRISPR en plásmidos: El caso de Klebsiella pneumoniae José Luis González Pimentel
Universidad Pablo de Olavide, Sevilla
Cod: s3_3
La biodiversidad de lo extremo: procariotas de los suelos hipersalinos de las Marismas del Odiel Cristina Galisteo
Universidad de Sevilla, Sevilla
SIEGA: Sistema Integrado de Epidemiología Genómica de Andalucía Carlos Sanchez Casimiro-Soriguer
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Almuerzo
Sesión de posters y café
Sesión 4 - Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos ómicos en diagnóstico clínico e investigación I
Chairman: Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina ComputacionalCaracterización molecular de modelos murinos espontáneos de lupus eritematoso sistémico e integración con pacientes humanos María Rivas Torrubia
Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada
A therapy-oriented study on soft tissue sarcoma Miriam Payá Milans
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
The landscape of epigenetic aging in the context of COVID-19 disease Elena Povedano Espejo
Instituto de Economía, Geografía y Demografía (IEGD-CSIC), Madrid
Charla plenaria: Design and implementation of Research Infrastructures at national and European scale Salvador Capella
Líder del Nodo de Coordinación del Instituto Nacional de Bioinformática (INB) de España en el (BSC).
Evento social: Abades Triana
Sesión 5 - IA, aprendizaje automático y profundo en Bioinformática II
Chairman: Francisco Manuel Ortuño, Universidad de GranadaHerramienta de diagnóstico inteligente basada en IA para predecir el riesgo de deterioro cognitivo asociado a hipoacusia Maria Amparo Callejón Leblic
Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla
Deep learning para la predicción del fenotipo a partir de datos de expresión de célula única Jordi Martorell Marugán
Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada
Early prediction of ovarian cancer risk based on real world data Victor de la Oliva Roque
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
RNA-to-image multi-cancer synthesis using cascaded diffusion models Francisco Carrillo-Pérez
Universidad de Stanford
Reposicionamiento de fármacos guiado por modelos mecanísticos y de aprendizaje automático Marina Esteban Medina
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Charla plenaria: Interpretable deep learning for cancer personalized medicine María Rodríguez
IBM Research Laboratory, Zurich
Descanso / Café
Sesión 6 - Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos ómicos en diagnóstico clínico e investigación II
Chairman: Pedro Carmona Sáez, Universidad de Granda - GENyOAnálisis ómicos para el diagnóstico de enfermedades raras y/o hereditarias en la Plataforma de Medicina Computacional Virginia Aquino
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Los efectos de la divergencia evolutiva en la región del HLA en las enfermedades autoimmunes Ruth Domínguez Rodríguez
Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada
Integration of different miRNA-target correlation strategies using rare disease sequencing data José Córdoba Caballero
Instituto de Investigación e Innovación Biomédica (INIBICA), Cádiz
Servidores de variabilidad genética española Daniel López López
Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla
Charla plenaria: The illusion of function prediction, a review Ana Rojas
Investigadora Principal en grupo de Bioinformática y Biología Computacional en Centro Andaluz de Biología de Desarrollo (CABD-CSIC)
Clausura Joaquin Dopazo
Director de la Plataforma de Medicina Computacional
Ponentes invitados
Fátima Al-Shahrour
Jefa de la Unidad de Bioinformática en el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO) de España.
María Rodríguez
Líder Técnica en Biología de Sistemas Computacionales,Laboratorio de investigación IBM Zurich
Ana Rojas
Investigadora Principal en grupo de Bioinformática y Biología Computacional en Centro Andaluz de Biología de Desarrollo (CABD-CSIC)
Salvador Capella
Líder del Nodo de Coordinación del Instituto Nacional de Bioinformática (INB) de España en el (BSC).
Dolores Muñoyerro
Subdirectora de Gestión de la Información en el Servicio Andaluz de Salud.
Carlos Rodríguez
Lead NLP Engineering, Centro de Excelencia Global de Data Intelligence, Fujitsu.
Jose Manuel Jerez
Catedrático de Universidad, Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación, Universidad de Málaga.
Sebastian Ventura
Catedrático de Universidad, Departamento de Ciencias de la Computación y Análisis Numérico, Universidad de Córdoba
Localización Del Evento
Galería e información sobre la ubicación del evento
ETS de Ingeniería Informática:
Universidad de Sevilla, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática
Salón de actos
Av. Reina Mercedes s/n, 41012 Sevilla
Recomendación de alojamiento
Algunos alojamientos cercanos al evento
F.A.Q
Preguntas frecuentes
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¿Cuándo y dónde se realizará el evento de bioinformática?
El evento de bioinformática tendrá lugar del 3 al 5 de Julio en la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla, Salón de actos - Av. Reina Mercedes s/n, 41012 Sevilla.
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¿Cómo me inscribo en el evento?
El plazo de inscripción ha finalizado.
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¿Cómo se realiza el pago?
Una vez inscrito/a al evento, se le enviarán instrucciones para realizar el pago de la inscripción.
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¿Qué temas se cubrirán en el evento?
Las jornadas están enfocadas a la bioinformática en su sentido más amplio, como una discipliona que aglutina grupos que trabajan en ciencia de datos, biología computacional, genómica, biología de sistemas, evolución, estructura de biomoléculas, informática médica, inteligencia artificial, etc., y desde un abanico de aproximaciones que va desde la investigación básica basada en datos a la orientación técnica del desarrollo de aplicaciones y software bioinformático.
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¿Hay oportunidades para presentar mi trabajo al evento?
El plazo para el envío de contribuciones ha finalizado. Para cualquier cuestión relacionada con las contribuciones, contacta con: jabi2023@clinbioinfosspa.es
Si tu trabajo es aceptado, para poder presentarlo en las jornadas (oral o poster) deberás registrarte.
Existe una fecha límite para el envío de trabajos, concretamente el día
22 de Mayo2 de Junio, posteriormente el comité organizador lo revisará y notificará a los autores en relación a su posible aceptación el día9 de Junio12 de Junio.
Contacto
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Dirección
Plataforma de Medicina ComputacionalEdificio C.D.C.A. Hospital Universitario Virgen del Rocío Avenida Manuel Siurot s/n, 41013 Sevilla, Spain
