Bienvenido a las Jornadas
Andaluzas de Bioinformática
JABI 2023

3-5 Julio, ETS de Ingeniería Informática, Sevilla

Sobre el evento

Sobre el evento

Descripción general:

Les damos la bienvenida a las primeras Jornadas Andaluzas de BioInformática (JABI 2023), un foro de interacción desde el que se fomenta la sinergia dentro de la creciente comunidad de bioinformática en Andalucía.

Las JABI entienden la bioinformática en su sentido más amplio, como una disciplina que aglutina grupos que trabajan en ciencia de datos, biología computacional, genómica, biología de sistemas, evolución, estructura de biomoléculas, agricultura, informática médica, inteligencia artificial, etc., y desde un abanico de aproximaciones que va desde la investigación básica basada en datos a la orientación técnica del desarrollo de aplicaciones y software bioinformático.

Es un hecho que el abaratamiento de las tecnologías de producción de datos, como las distintas ómicas, imagen, datos clínicos, etc., está provocando un crecimiento en la comunidad bioinformática. En Andalucía existe un importante número de grupos con amplia experiencia en el manejo de datos ómicos y una clara orientación traslacional que conviven con otros grupos que provienen de la Ingeniería Informática con sólidos conocimiento en modernas técnicas de estadística e inteligencia artificial (IA) y vocación de aplicar estos conocimientos a problemas de biomedicina. También, numerosos grupos de investigación en biología molecular, clínicos, agricultura, etc. están dando el salto al análisis de datos incluyendo profesionales con perfil bioinformático en equipos teórico-experimentales.

Las JABI pretenden ser un foro de referencia en Andalucía para promover el intercambio de experiencias y conocimiento en la comunidad bioinformática de Andalucía y el establecimiento de relaciones entre grupos con intereses comunes o complementarios.

Comité de organización

Comité organizador:

  • Joaquin Dopazo Blázquez, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
  • Francisco Manuel Ortuño Guzmán, Plataforma de Medicina Computacional / Universidad de Granada
  • Coral del Val, Universidad de Granada
  • Antonio J. Pérez Pulido , Universidad Pablo de Olavide
  • Manuel Gonzalo Claros, Universidad de Málaga
  • Pedro Carmona, Universidad de Granada / GENyO
  • Isabel Nepomuceno, Universidad de Sevilla

Comité local:

  • Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
  • Inmaculada Guillén, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud
  • Belén Vega Márquez, Universidad de Sevilla

Comité estudiantes:

  • Kristina Lacasta López, Universidad de Sevilla
  • Gema Misra Cabezas, Universidad de Sevilla
  • Rocío Jiménez Arias, Universidad de Sevilla
  • Noelia Collado Gisbert, Universidad de Sevilla
  • María González Genil, Universidad de Sevilla
  • Carmen Rodríguez Res, Universidad de Sevilla

Fechas

  • Fecha del evento: del 3 al 5 de Julio de 2023
  • Apertura de registro y envio de comunicaciones: 10 de Abril de 2023
  • Fecha límite de envio de comunicaciones: 22 de Mayo  2 de Junio de 2023
  • Notificaciones de comunicaciones: 9 de Junio  12 de Junio de 2023
  • Fecha límite de registro: 15 de Junio de 2023

Dónde

ETS de Ingeniería Informática:

Universidad de Sevilla, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Salón de actos
Av. Reina Mercedes s/n, 41012 Sevilla

Programa

Inicio del evento

Registro

Confirmación de los datos de inscripción.

Inauguración de las JABI

Isaac Tunez

D. Isaac Túnez Fiñana. Secretario General de Investigación, Desarrollo e Innovación

Consejería de Salud y Consumo, Junta de Andalucía

Isaac Tunez

D. Gonzalo Balbontín Casillas. Director Gerente

Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud

Ana Maria Porcel

Dña. Ana María Porcel Gálvez. Directora del Secretariado de Promoción de la Investigación

Universidad de Sevilla

Cristina Rubio Escudero

Dña. Cristina Rubio Escudero. Subdirectora de Relaciones Internacionales, Comunicación y Divulgación, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla

Joaquin dopazo

D. Joaquín Dopazo Blázquez. Director de la Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

 
 
 

Sesión 1 - Agricultura y Bioinformática

Chairman: Antonio J.Pérez Pulido, Universidad Pablo de Olavide

Cod: s1_1

EasyGDB: una herramienta de libre acceso de fácil implementación y mantenimiento para el desarrollo de portales genómicos. El caso del atlas de olivo Amanda Bullones

Instituto Hortofruticula Subtropical y Mediterránea "La Mayora" (IHSM - CSIC - UMA), Málaga


Cod: s1_2

Combining Long-Read and Short-Read Sequencing Technologies in the Study of a Red Spider Mite-Resistant Mutant of S. lycopersicum: Technical Aspects and (Epi)-Transcriptomics. José María Medina Muñoz

Universidad de Granada


Cod: s1_3

Técnicas bioinformáticas para el estudio de modificaciones postraduccionales: el caso de la carbonilación en polen de olivo (Olea europaea L.) Salvador Priego Poyato

Estación Experimental del Zaidín (CSIC), Granada


Cod: s1_4

RSeqFlow, an R markdown workflow tailored for olive pollen tube growth profiling M.Gonzalo Claros

Instituto Hortofruticula Subtropical y Mediterránea "La Mayora" (IHSM - CSIC - UMA), Málaga

 
 
Hora del café

Descanso / Café

Dolores Muñoyerro

Charla plenaria: Base Poblacional de Salud. Un recurso para la generación de Conocimiento y Salud Dolores Muñoyerro

Subdirectora de Gestión de la Información en el Servicio Andaluz de Salud

 

Sesión 2 - IA, aprendizaje automático y profundo en Bioinformática I

Chairman: Isabel Nepomuceno, Universidad de Sevilla

Cod: s2_1

Homological tools of boundary-scale models for analysis of Biological Graphs Alberto Monterroso Muñoz

Universidad de Sevilla

Plataforma de gestión y análisis de bioseñales cerebrales y modelo predictivo de detección de potenciales evocados auditivos basado en IA Sergio Blanco Trejo

Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla

Reducción del batch effect para métodos de Machine Learning en espectros de Mycobacterium generados con MALDI-TOF Erica Padial Fuillerat

Clover Bioanalytical Software,Granada

Mesa redonda: Inteligencia Artificial y Bioinformática

Joaquin dopazo

Moderador: D. Joaquín Dopazo Blázquez. Director de la Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

Carlos Rodriguez

Codificación y explotación eficiente de datos clínicos mediante IA y NLP - Carlos Rodríguez Abellán. Lead NLP Engineering, Centro de Excelencia Global de Data Intelligence, Fujitsu

Jose Manuel Jerez

Herramientas computacionales para extracción de información de una historia clínica oncológica - Jose Manuel Jerez Aragonés. Catedrático de Universidad, Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación, Universidad de Málaga

Sebastian Ventura

Sebastian Ventura. Catedrático de Universidad, Departamento de Ciencias de la Computación y Análisis Numérico, Universidad de Córdoba

 
 
Hora del café

Descanso / Café

Fatima Al-Shahrour

Charla plenaria: Nuevas estrategias en Bioinformática para el tratamiento contra el cáncer Fátima Al-Shahrour

Directora Unidad de Bioinformática en el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO)

 
 
 

Sesión 3 - Microbiología y Bioinformática

Chairman: M.Gonzalo Claros Diaz, Universidad de Málaga

Vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Andalucía: origen, hitos y estado actual Javier Pérez Florido

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla


Cod: s3_2

CRISPR en plásmidos: El caso de Klebsiella pneumoniae José Luis González Pimentel

Universidad Pablo de Olavide, Sevilla


Cod: s3_3

La biodiversidad de lo extremo: procariotas de los suelos hipersalinos de las Marismas del Odiel Cristina Galisteo

Universidad de Sevilla, Sevilla

SIEGA: Sistema Integrado de Epidemiología Genómica de Andalucía Carlos Sanchez Casimiro-Soriguer

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

 
 
Almuerzo

Almuerzo

 
 
 

Sesión 4 - Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos ómicos en diagnóstico clínico e investigación I

Chairman: Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina Computacional

Caracterización molecular de modelos murinos espontáneos de lupus eritematoso sistémico e integración con pacientes humanos María Rivas Torrubia

Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada

A therapy-oriented study on soft tissue sarcoma Miriam Payá Milans

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

The landscape of epigenetic aging in the context of COVID-19 disease Elena Povedano Espejo

Instituto de Economía, Geografía y Demografía (IEGD-CSIC), Madrid

 
 
Salvador Capella

Charla plenaria: Design and implementation of Research Infrastructures at national and European scale Salvador Capella

Líder del Nodo de Coordinación del Instituto Nacional de Bioinformática (INB) de España en el (BSC).

Evento social

Evento social: Abades Triana

 

Sesión 5 - IA, aprendizaje automático y profundo en Bioinformática II

Chairman: Francisco Manuel Ortuño, Universidad de Granada

Herramienta de diagnóstico inteligente basada en IA para predecir el riesgo de deterioro cognitivo asociado a hipoacusia Maria Amparo Callejón Leblic

Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla

Deep learning para la predicción del fenotipo a partir de datos de expresión de célula única Jordi Martorell Marugán

Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada

Early prediction of ovarian cancer risk based on real world data Victor de la Oliva Roque

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

RNA-to-image multi-cancer synthesis using cascaded diffusion models Francisco Carrillo-Pérez

Universidad de Stanford

Reposicionamiento de fármacos guiado por modelos mecanísticos y de aprendizaje automático Marina Esteban Medina

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

 
 
Maria Rodiguez

Charla plenaria: Interpretable deep learning for cancer personalized medicine María Rodríguez

IBM Research Laboratory, Zurich

Hora del café

Descanso / Café

 
 
 

Sesión 6 - Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos ómicos en diagnóstico clínico e investigación II

Chairman: Pedro Carmona Sáez, Universidad de Granda - GENyO

Análisis ómicos para el diagnóstico de enfermedades raras y/o hereditarias en la Plataforma de Medicina Computacional Virginia Aquino

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

Los efectos de la divergencia evolutiva en la región del HLA en las enfermedades autoimmunes Ruth Domínguez Rodríguez

Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada

Integration of different miRNA-target correlation strategies using rare disease sequencing data José Córdoba Caballero

Instituto de Investigación e Innovación Biomédica (INIBICA), Cádiz

Servidores de variabilidad genética española Daniel López López

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

 
 
Ana Rojas

Charla plenaria: The illusion of function prediction, a review Ana Rojas

Investigadora Principal en grupo de Bioinformática y Biología Computacional en Centro Andaluz de Biología de Desarrollo (CABD-CSIC)

Joaquin dopazo

Clausura Joaquin Dopazo

Director de la Plataforma de Medicina Computacional

Ponentes invitados

Fatima Al-Shahrour

Fátima Al-Shahrour

Jefa de la Unidad de Bioinformática en el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO) de España.

Maria Rodriguez

María Rodríguez

Líder Técnica en Biología de Sistemas Computacionales,Laboratorio de investigación IBM Zurich

Ana Rojas

Ana Rojas

Investigadora Principal en grupo de Bioinformática y Biología Computacional en Centro Andaluz de Biología de Desarrollo (CABD-CSIC)

Salvador Capella

Salvador Capella

Líder del Nodo de Coordinación del Instituto Nacional de Bioinformática (INB) de España en el (BSC).

Dolores Muñoyerro

Dolores Muñoyerro

Subdirectora de Gestión de la Información en el Servicio Andaluz de Salud.

Carlos Rodríguez

Carlos Rodríguez

Lead NLP Engineering, Centro de Excelencia Global de Data Intelligence, Fujitsu.

Jose Manuel Jerez

Jose Manuel Jerez

Catedrático de Universidad, Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación, Universidad de Málaga.

Sebastian Ventura

Sebastian Ventura

Catedrático de Universidad, Departamento de Ciencias de la Computación y Análisis Numérico, Universidad de Córdoba

Localización Del Evento

Galería e información sobre la ubicación del evento

ETS de Ingeniería Informática:

Universidad de Sevilla, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática
Salón de actos
Av. Reina Mercedes s/n, 41012 Sevilla


https://www.informatica.us.es/

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F.A.Q

Preguntas frecuentes

  • El evento de bioinformática tendrá lugar del 3 al 5 de Julio en la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla, Salón de actos - Av. Reina Mercedes s/n, 41012 Sevilla.

  • El plazo de inscripción ha finalizado.

  • Una vez inscrito/a al evento, se le enviarán instrucciones para realizar el pago de la inscripción.

  • Las jornadas están enfocadas a la bioinformática en su sentido más amplio, como una discipliona que aglutina grupos que trabajan en ciencia de datos, biología computacional, genómica, biología de sistemas, evolución, estructura de biomoléculas, informática médica, inteligencia artificial, etc., y desde un abanico de aproximaciones que va desde la investigación básica basada en datos a la orientación técnica del desarrollo de aplicaciones y software bioinformático.

  • El plazo para el envío de contribuciones ha finalizado. Para cualquier cuestión relacionada con las contribuciones, contacta con: jabi2023@clinbioinfosspa.es

    Si tu trabajo es aceptado, para poder presentarlo en las jornadas (oral o poster) deberás registrarte.

    Existe una fecha límite para el envío de trabajos, concretamente el día 22 de Mayo 2 de Junio, posteriormente el comité organizador lo revisará y notificará a los autores en relación a su posible aceptación el día 9 de Junio 12 de Junio.

Contacto

Contacta con nosotros.

Dirección

Plataforma de Medicina Computacional
Edificio C.D.C.A. Hospital Universitario Virgen del Rocío Avenida Manuel Siurot s/n, 41013 Sevilla, Spain

Teléfono

+34 677 91 06 85


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Inscripción

Acceso
80€

  • Entrada a las jornadas de bioinformática y sus sesiones
  • Café durante las jornadas
  • Almuerzo y evento social del 4 de Julio

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