JABI 2023 - VOTACIONES

Votaciones

Dispones de 2 votos en total, uno para la mejor presentación oral y otro para el mejor poster

Presentaciones orales
1 voto disponible
Sesión de posters
1 voto disponible

Presentaciones orales

Sesión 1 - Agricultura y Bioinformática

Chairman: Antonio J.Pérez Pulido, Universidad Pablo de Olavide

15:30 - 15:50
Cod: s1_1

EasyGDB: una herramienta de libre acceso de fácil implementación y mantenimiento para el desarrollo de portales genómicos. El caso del atlas de olivo Amanda Bullones

Instituto Hortofruticula Subtropical y Mediterránea "La Mayora" (IHSM - CSIC - UMA), Málaga

15:50 - 16:10
Cod: s1_2

Combining Long-Read and Short-Read Sequencing Technologies in the Study of a Red Spider Mite-Resistant Mutant of S. lycopersicum: Technical Aspects and (Epi)-Transcriptomics. José María Medina Muñoz

Universidad de Granada

16:10 - 16:30
Cod: s1_3

Técnicas bioinformáticas para el estudio de modificaciones postraduccionales: el caso de la carbonilación en polen de olivo (Olea europaea L.) Salvador Priego Poyato

Estación Experimental del Zaidín (CSIC), Granada

16:30 - 16:50
Cod: s1_4

RSeqFlow, an R markdown workflow tailored for olive pollen tube growth profiling M.Gonzalo Claros

Instituto Hortofruticula Subtropical y Mediterránea "La Mayora" (IHSM - CSIC - UMA), Málaga

Sesión 2 - IA, aprendizaje automático y profundo en Bioinformática I

Chairman: Isabel Nepomuceno, Universidad de Sevilla

09:00 - 09:20
Cod: s2_1

Homological tools of boundary-scale models for analysis of Biological Graphs Alberto Monterroso Muñoz

Universidad de Sevilla

09:20 - 09:40
Cod: s2_2

Plataforma de gestión y análisis de bioseñales cerebrales y modelo predictivo de detección de potenciales evocados auditivos basado en IA Sergio Blanco Trejo

Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla

09:40 - 10:00
Cod: s2_3

Reducción del batch effect para métodos de Machine Learning en espectros de Mycobacterium generados con MALDI-TOF Erica Padial Fuillerat

Clover Bioanalytical Software,Granada

Sesión 3 - Microbiología y Bioinformática

Chairman: M.Gonzalo Claros Diaz, Universidad de Málaga

13:00 - 13:20
Cod: s3_1

Vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Andalucía: origen, hitos y estado actual Javier Pérez Florido

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

13:20 - 13:40
Cod: s3_2

CRISPR en plásmidos: El caso de Klebsiella pneumoniae José Luis González Pimentel

Universidad Pablo de Olavide, Sevilla

13:40 - 14:00
Cod: s3_3

La biodiversidad de lo extremo: procariotas de los suelos hipersalinos de las Marismas del Odiel Cristina Galisteo

Universidad de Sevilla, Sevilla

14:00 - 14:20
Cod: s3_4

SIEGA: Sistema Integrado de Epidemiología Genómica de Andalucía Carlos Sanchez Casimiro-Soriguer

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

Sesión 4 - Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos ómicos en diagnóstico clínico e investigación I

Chairman: Javier Pérez Florido, Plataforma de Medicina Computacional

16:30 - 16:50
Cod: s4_1

Caracterización molecular de modelos murinos espontáneos de lupus eritematoso sistémico e integración con pacientes humanos María Rivas Torrubia

Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada

16:50 - 17:10
Cod: s4_2

A therapy-oriented study on soft tissue sarcoma Miriam Payá Milans

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

17:10 - 17:30
Cod: s4_3

The landscape of epigenetic aging in the context of COVID-19 disease Elena Povedano Espejo

Instituto de Economía, Geografía y Demografía (IEGD-CSIC), Madrid

Sesión 5 - IA, aprendizaje automático y profundo en Bioinformática II

Chairman: Francisco Manuel Ortuño, Universidad de Granada

09:00 - 09:20
Cod: s5_1

Herramienta de diagnóstico inteligente basada en IA para predecir el riesgo de deterioro cognitivo asociado a hipoacusia Maria Amparo Callejón Leblic

Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla

09:20 - 09:40
Cod: s5_2

Deep learning para la predicción del fenotipo a partir de datos de expresión de célula única Jordi Martorell Marugán

Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada

09:40 - 10:00
Cod: s5_3

Early prediction of ovarian cancer risk based on real world data Victor de la Oliva Roque

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

10:00 - 10:20
Cod: s5_4

RNA-to-image multi-cancer synthesis using cascaded diffusion models Francisco Carrillo-Pérez

Universidad de Stanford

10:20 - 10:40
Cod: s5_5

Reposicionamiento de fármacos guiado por modelos mecanísticos y de aprendizaje automático Marina Esteban Medina

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

Sesión 6 - Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos ómicos en diagnóstico clínico e investigación II

Chairman: Pedro Carmona Sáez, Universidad de Granda - GENyO

12:10 - 12:30
Cod: s6_1

Análisis ómicos para el diagnóstico de enfermedades raras y/o hereditarias en la Plataforma de Medicina Computacional Virginia Aquino

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

12:30 - 12:50
Cod: s6_2

Los efectos de la divergencia evolutiva en la región del HLA en las enfermedades autoimmunes Ruth Domínguez Rodríguez

Centro de Genómica e Investigación Oncológica (GENyO), Granada

12:50 - 13:10
Cod: s6_3

Integration of different miRNA-target correlation strategies using rare disease sequencing data José Córdoba Caballero

Instituto de Investigación e Innovación Biomédica (INIBICA), Cádiz

13:10 - 13:30
Cod: s6_4

Servidores de variabilidad genética española Daniel López López

Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud, Sevilla

Posters

Día: 4 de Julio - 15:20 a 16:30

Explorando la biodiversidad de las salinas de Isla Cristina mediante análisis metagenómicos Metagenómica

Alicia García Roldán y Blanca Vera Gargallo, Dpto Microbiología y Parasitología - Facultad de Farmacia - Universidad de Sevilla

The reanalyzerGSE pipeline: tackling the everlasting lack of reproducibility and reanalyses in transcriptomics data

José L Ruiz, Instituto de Parasitología y Biomedicina López-Neyra (IPBLN-CSIC)

Impact of microRNAs deregulation on the mobility of LINE-1 retrotransposons in colon cancer

Pilar G. Marchante, Dpto. Bioquímica y Biología Molecular II (Universidad de Granada) / GENYO

Computación en tiempo real para biomedicina hiperespectral mediante hardware reconfigurable

Daniel Fernández Gámez, Carlos González Calvo y Daniel Mozos Muñoz

The most exposed regions of SARS-CoV-2 structural proteins are subject to strong positive selection and gene overlap may locally modify this behavior

Alejandro Rubio Valle, Universidad Pablo de Olavide

SPETO-RNA: Streamlined Process for Efficient Transcriptomic Analysis of RNA-seq

Belén Delgado Martín, Unidad de Bioinformática - SCBI, Universidad de Málaga

Análisis de la asociación entre bacteriófagos y cepas relacionadas a la bacteria Pseudomonas aeruginosa

Antonio Moreno Rodríguez, Universidad Pablo de Olavide

Identificación de factores de patogenicidad en aislados de Escherichia coli de pacientes trasplantados renales con bajo nivel de resistencia a quinolonas y/o fosfomicina.

Soraya Herrera Espejo, Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/ Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Parasitología, Hospital Universitario Virgen del Rocío/CSIC/Universidad de Sevilla

ABC-MK: an efficient and robust approach to infer the rate and strength of adaptation

Jesus Murga-Moreno, Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Arizona

P10

OTOVIRT: Una herramienta para el modelado de imágenes médicas para el soporte al diagnóstico y la simulación de cirugías virtuales del oído

Manuel Lazo-Maestre, Servicio de ORL, Hospital Universitario Virgen Macarena

P11

PROTEOMIC ANALYSIS OF THP-1 CELLS EXPOSED TO DYSLIPIDEMIC AND ATHEROSCLEROTIC SERUMS

Francisco Rodríguez Martin y María Carmen Durán Ruíz, Biomedical Research and Innovation Institute of Cadiz (INiBICA) & Biomedicine, Biotechnology and Public Health Dpt., University of Cádiz

P12

DExMA: meta-analisis de expresión génica e imputación de genes faltantes

Juan Antonio Villatoro García, Departamento de Estadística e Investigación Operativa, Universidad de Granada y GENYO Centre for Genomics and Oncological Research: Pfizer / University of Granada / Andalusian Regional Government, PTS Granada, Granada 18016

P13

Inferencia causal en redes de comorbilidad a partir de registros clínicos electrónicos

Marina Vargas Fernández, Universidad de Granada

P14

SigPrimedNet: Known and unknown cell types annotation with a signaling-informed neural network in scRNA-seq dataset

Pelin Gundogdu, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P15

Graph Neural Network-Based Models in a Generative Framework for Imputation of Clinical Time Series Data of ICU Patients

Javier Solís-García, Dpto. LSI, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla

P16

The Skeletal Atlas: A holistic approach to transcriptomics in the skeleton.

Jose Miguel Pérez Tejeiro, University of Malaga, Cell Biology, Genetics and Physiology and Institute of Biomedical Research in Málaga (IBIMA), IBIMA-RARE

P17

Systems Biology for overproduction of ectoines in the halophilic bacterium Chromohalobacter salexigens.

Lourdes Martínez Martínez, Universidad de Sevilla

P18

Characterization of KMT2A rearrangement in pediatric Acute Myeloid Leukemia and drug repurposing from transcriptomic data.

Ivan Ellson Lancho, GENYO Centre fo Genomics and Oncological Research: Pfizer, University of Granada, Andalusian Regional Government, Granada

P19

BioinfoGRX: Impulsando la Divulgación y Formación en Bioinformática para una Comunidad en Crecimiento.

Erica Padial Fuillerat, Albert M. Parra-Perez, Ivan Ellson Lancho, Raúl López-Domínguez, Adrian García Moreno. Asociación Andaluza BioinformaticsGRX, Clover Bioanalytical Software y Asociación Andaluza BioinformaticsGRX, Grupo de Bioinformática Estadística y Biomedicina de Sistemas, Departamento de Estadística e Investigación Operativa, Universidad de Granada y Unidad de Bioinformática, GENYO, Centro Pfizer/Universidad de Granada/Junta de Andalucía de Genómica e Investigación Oncológica, PTS, Granada

P20

Herramienta bioinformática para la identificación de motivos conservados en promotores bacterianos.

Antonio Arroyo Mateo, Área de Genética, Facultad de Ciencias, Campus Teatinos, Universidad de Málaga y Departamento de Microbiología/Protección de Cultivos, Instituto de Hortofruticultura Subtropical Mediterránea «La Mayora», Extensión Campus Teatinos, Universidad de Málaga‐Consejo Superior de Investigaciones Científicas (IHSM‐UMA‐CSIC)

P21

Explorando el secretoma de Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi: Un enfoque bioinformático para el análisis de proteínas secretadas durante la interacción planta-patógeno.

Hilario Domínguez Cerván, Área de Genética Facultad de Ciencias, Campus Teatinos, Universidad de Málaga/Microbiología y Protección de Cultivos, Instituto de Hortofruticultura Subtropical Mediterránea “La Mayora”, Extensión Campus de Teatinos, Universidad de Málaga-Consejo Superior de Investigaciones Científicas (IHSM-UMA-CSIC), Málaga

P22

Discovery and validation of novel variants in unresolved Meniere's disease cases.

Álvaro Gallego-Martinez, Otology and Neurotology Group CTS495, GENYO - Centre for Genomics and Oncological Research - Pfizer, University of Granada, Junta de Andalucía

P23

Estrategia de validación de modelos predictivos basados en inteligencia artificial para la predicción de mortalidad a medio plazo en pacientes ingresados por COVID-19.

Andreea Madalinaa, Departamento de Tecnología Electrónica, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla

P24

Discovery of novel proteomic biomarkers for the early diagnosis of Bronchopulmonary Dysplasia in preterm infants.

Fernando Garrido Muñoz, Perinatal Brain Damage Group. Biomedical Research and Innovation Institute of Cadiz (INiBICA). Puerta del Mar University Hospital, Cádiz

P25

A set of tools to perform meta-analysis, discover subtle methylation regions, unbiased enrichment analyses, to analyses lupus omics datasets and integrate Covid19 and environmental data.

Adrían García Moreno, GENYO, Centre for Genomics and Oncological Research: Pﬁzer/University of Granada/Andalusian Regional Government, PTS Granada

P26

Women's oral microbiome in hyposalivation aging-related and disease.

Carlos Saúco Carballo, Universidad de Sevilla

P27

Characterizing the FRT-GIT Microbiome in Infertility: Insights from 16S rRNA Analysis.

María Jiménez Rus, Departamento de Estomatología. Facultad de Odontología, Universidad de Sevilla

P28

Optimizando el análisis de Metagenómica por Shotgun: MeTaxFun.

Isabel María Cerezo Ortega y Rocío Bautista Moreno, Unidad de Bioinformática - SCBI, Universidad de Málaga

P29

A Feature Selection and Association Rule Approach to Identify Genes Associated with Metastasis and Low Survival in Sarcoma.

María Martínez Ballesteros, Universidad de Sevilla

P30

Descubrimiento de interacciones potenciales entre enfermedades raras y COVID-19 mediante la combinación de modelos mecanísticos de la infeccion viral con modelos estadísticos.

Macarena López Sánchez, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P31

Hipathia and Metabolizer: Unveiling Disease Mechanisms and Enabling Personalized Medicine.

Kinza Rian, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P32

CSVS: El Servidor Colaborativo de Variabilidad Genética Española.

María Peña-Chilet, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P33

The Spanish Polygenic Risk Score Reference Distribution: A Resource for Personalized Medicine.

Daniel López López, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P34

A crowdsourcing database for the copy-number variation of the Spanish population.

Daniel López López, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P35

Evolución del SARS-CoV-2 en una cohorte de pacientes inmunodeprimidos.

Andrea Aguado Marín, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P36

Vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Andalucía: origen, hitos y estado actual.

Javier Pérez-Florido, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P37

Detection of co-infection events and the emergence of novel SARS-CoV-2 recombinants in the epidemiological surveillance of Andalusia (Spain).

Javier Pérez-Florido, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P38

Impact of SARS-CoV-2 lineages and mutations on the survival of hospitalized patients.

Carlos Loucera, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P39

Circuito de vigilancia por secuenciación genómica de virus en Andalucía.

María Lara Jiménez, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P40

Estudio genómico de una familia de Salmonella enterica aislada en Andalucía.

María Lara Jiménez, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P41

Molecular and phylogenetic characterization of the monkeypox outbreak in the South of Spain.

Carlos Sánchez Casimiro-Soriguer, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P42

Generative deep learning-based models to build synthetic fetal cardiotocography data.

Halal Abdulrahman Ahmed1, Minerva Lab Data Science, Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática, Universidad de Sevilla

P43

SIEGA: Sistema Integrado de Epidemiología Genómica de Andalucía.

Carlos Sanchez Casimiro-Soriguer, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P44

Generación de registros electrónicos de salud sintéticos a partir de una cohorte de ~1 millón de pacientes diabéticos.

Francisco Manuel Ortuño Guzmán, Departamento de Ingeniería de Computadores, Automática y Robótica, Universidad de Granada / Plataforma de Medicina Computacional. Fundación Pública Andaluza Progreso y Salud

P45

Hacia la Medicina de Precisión: la Plataforma Andaluza de Medicina Computacional y la Base Poblacional de Salud.

Laura Alejos Collado, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P46

Reposicionamiento de fármacos guiado por modelos mecanísticos y de aprendizaje automático.

Marina Esteban, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

P47

Early prediction of ovarian cancer risk based on real world data.

Alberto Esteban Medina, Plataforma de Medicina Computacional, Fundación Progreso y Salud

Has realizado correctamente las 2 votaciones, gracias por tu colaboración. Se conocerán los resultados de los ganadores a la mejor presentación oral y al mejor poster en la clausura de las JABI.

Instrucciones presentación ORAL:

Las comunicaciones orales se presentarán en las sesiones previstas:
- Lunes 3. Sesión 1 (15:30 - 16:50)
- Martes 4. Sesión 2 (9:00 - 10:00), Sesión 3 (13:00 - 14:20), Sesión 4 (16:30 - 17:30)
- Miércoles 5. Sesión 5 (9:00 - 10:40), Sesión 6 (12:10 - 13:30)
Los autores de comunicaciones aceptadas como ORAL, deberán realizar una PRESENTACIÓN ORAL para su discusión en la sala dispuesta por la organización para tal fin.
Cada presentación oral dispondrá de un tiempo máximo de 20 minutos (15 minutos de exposición y 5 minutos de discusión).
La presentación oral debe estar en formato PDF y NO se entregará en sede. Debe enviarse antes del 3 de Julio a las 10:00 (hora peninsular) a la dirección jabi.automatic@gmail.com. Para la rápida identificación de la presentación oral, se recomienda nombrar el archivo PDF con el código de presentación disponible en el Programa de las jornadas en http://jabi2023.clinbioinfosspa.es/
Incluir en la primera diapositiva del documento de presentación oral, el logo de las JABI

Instrucciones presentación PÓSTER:

Los autores de las comunicaciones PÓSTER deberán colgar su póster en los paneles que habrá colocados en sede a partir del martes 4 de Julio a las 9:00. La sesión de pósters está prevista el martes 4 de Julio de 15:20 a 16:30 y deberán ser retirados el miércoles 5 de Julio a las 15:00. Más allá de esta hora, serán retirados por la organización.
En la parte superior de los paneles donde se colgarán los posters figurará el código de presentación que estará disponible en Sesión de posters. Rogamos lo tenga en cuenta al colocar su poster en el panel.
Tamaño del póster: A0 (84,1 x 118,9 cm), formato vertical
El tamaño de las letras, figuras o gráficos utilizados en el diseño de la presentación debe ser legible, fácilmente, a una distancia de 1-2 metros.
El modo de fijación será proporcionado por la organización. Se facilitará cinta a doble cara para colgar los posters en los paneles
Es recomendable que los autores dispongan de copias del trabajo (p.e. del mismo póster en tamaño reducido) para ofrecer a los restos de asistentes que se interesen por el mismo.
Además de llevar a las jornadas el póster físico para colgar en el panel correspondiente, se recomienda, aunque no es obligatorio, remitir a jabi.automatic@gmail.com un archivo PDF con el póster final para ser publicado en la web de las jornadas con el código de presentación en el nombre del archivo. Fecha límite para recepción del archivo: 30 de Junio a las 23:59 horas.
Incluir en el poster el logo de las JABI

Mejor presentación oral y mejor póster:

La organización de las JABI 2023 otorgará un reconocimiento a la mejor presentación oral y al mejor póster presentados en las jornadas de acuerdo a los resultados obtenidos por medio de una votación realizada por los asistentes.